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沈阳药科大学1931年创建于江西瑞金，其前身是在中国共产党和毛泽东主席亲切关怀下创办的中国工农红军卫生学校，是我国历史最悠久的综合性药科大学。

学校自1956年开始招收研究生，是我国首批获得博士、硕士学位授予权的单位之一，同时也是较早开展在职人员以研究生毕业同等学力申请硕士学位以及自行审定博士生指导教师的单位。学校现有药学博士后流动站1个，一级学科博士学位授权点2个，二级学科博士学位授权点19个，一级学科硕士授权点7个，二级学科硕士授权点51个，硕士专业学位授权点3个，形成了以药学为优势和特色，理学、工学、管理学和医学等学科门类协调发展的多学科体系。其中，药剂学为国家级重点学科，中药分析学为国家中医药管理局“十二五”中医药重点学科。药学和中药学两个一级学科为辽宁省重点学科，并被评为辽宁省“一流学科”立项建设学科；药物化学和药物分析学被评为辽宁省以冲击国家重点学科为目标的特色学科建设工程“提升学科”；中药学被评为辽宁省特色学科建设工程“特色学科”。1996年经教育部批准，建设国家理科基础科学研究和教学人才培养基地（医药学），1997年开始招收本、硕、博连读学生。2002年经教育部和国家发展改革委员会批准，建立国家生命科学与技术人才培养基地，招收本、硕连读学生，学制6年。