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物理学系成立于2005年9月。以物理学及其交叉学科领域的创新性人才培养、重要科学前沿问题和国家重大科学战略为己任,强调人才培养、科学研究和交流合作之间的相互促进和平衡发展,求实创新、追求卓越,致力于建设一个特色鲜明、优势突出、流动开放、与国际接轨的新型研究性物理系。
在海内外著名物理系和中国科学院相关研究所近50名专家学者的支持和帮助下,吸收国内物理系近三十年的发展经验,从结构规模、人才培养、运行机制,以及评价体系等方面借鉴国际一流物理系的先进理念,集教学、科研与服务为一体,采用教授委员会式的“教授治系”体制,在这一管理模式下,建立教学、科研、行政与对外交流等事务委员会,有效分担各方面服务性工作。